Перед проведением очистки и дезинфекции системы вентиляции с поверхности воздуховодов в нескольких точках берется материал для проведения микробиологической экспертизы на наличие нескольких видов бактерий. Экспертиза проводится лабораторией Центра Гигиены и Эпидемиологии г. Москвы.
Одновременно, врачом, аккредитованным СЭС, проводится санитарно-эпидемиологическое обследование систем вентиляции и кондиционирования, по результатам которого каждому заказчику выдается акт санитарно-эпидемиологического обследования, и даются рекомендации по проведению дезинфекции.